新品推薦 | 分泌蛋白質組學研究工具——疊氮基糖

分泌蛋白質組(secretome)是指細胞、組織等分泌的全部蛋白質。分泌蛋白（如細胞因子、生長因子和激素等）在細胞間信號傳遞等過程中發(fā)揮著關鍵的作用，其動態(tài)變化通常反映了細胞的生長情況和病理狀態(tài)。分泌蛋白構成了很大一部分藥物靶標，同時也是重要的生物標志物^[1]。細胞的條件培養(yǎng)基是分泌蛋白質組研究的重要樣本。

目前，基于生物質譜的蛋白質組學分析可以實現(xiàn)對分泌蛋白的系統(tǒng)研究^[2]，但該方法無法富集分泌蛋白，導致分泌蛋白的鑒定數(shù)目較少。此外，常規(guī)的分泌蛋白質組分析為了降低樣品的復雜性會使用無血清培養(yǎng)基進行細胞培養(yǎng)，而長時間無血清培養(yǎng)容易使細胞活性狀態(tài)改變。

圖1　蛋白糖基化后結合質譜分析的分泌蛋白富集流程圖^[3]

近年來，含有生物正交基團（如疊氮基）的非天然糖已被用于代謝標記糖基化蛋白質，從而實現(xiàn)對糖蛋白的細胞成像或選擇性富集并用于蛋白質組學分析。

該策略分為兩個步驟：

疊氮基糖類似物（圖1a）被添加到細胞培養(yǎng)基中，通過細胞內的聚糖生物合成途徑引入到糖蛋白上；然后通過點擊化學反應特異性地與成像探針或親和探針進行共價標記（圖1b）。由于分泌蛋白通常是糖蛋白，這種糖代謝標記已被用于分泌蛋白的標記和富集。N-疊氮乙酰半乳糖胺(GalNAz)、N-疊氮乙酰葡萄糖胺(GlcNAz)和N-疊氮乙酰甘露糖胺(ManNAz)是經典的疊氮基糖類似物，其應用見表1。

表1 幾種常用疊氮基糖代謝探針^[4-6]

隨著技術的發(fā)展，以上3種常用的商品化非天然糖代謝標記產品（表1）演化為Ac4ManNAz、Ac4GlcNAz和Ac4GalNAz，它們分別是四?；?/strong>的N-疊氮乙酰甘露糖胺、N-疊氮乙酰葡萄糖胺和N-疊氮乙酰半乳糖胺，?；笤黾恿似湓谠S多溶劑中的溶解度，使這種試劑的處理更容易。

近期我司新推出升級了疊氮基糖，特點：

※ 生物正交性——疊氮基基團較小，無反應性且不存在于生命系統(tǒng)中，因此疊氮基-糖化合物不會干擾內源性細胞通路和取代其自然發(fā)生的類似物；

※ 兼容性——在簡單的緩沖液條件下可有效使用磷酸化合物進行反應化學，不需要銅或還原劑等輔助試劑；

※ 化學選擇性——疊氮化物和膦基團不會與生物樣品的組分反應或干擾此類組分，而是彼此高效偶聯(lián)；

※ 通用性——疊氮化物標記可用于檢測、固定、偶聯(lián)或親和純化，具體取決于其與哪種膦活化化合物反應。

這些糖是天然單糖的疊氮化物衍生物，細胞使用翻譯后修飾生化途徑使蛋白糖基化。疊氮化物官能團很小且不與內源性分子發(fā)生反應。當輸送到細胞時，這些化合物被糖基化事件整合，以便有效地使用疊氮化物基團“標記"糖蛋白。然后疊氮化物基團可專門用于使用炔烴活化試劑（“點擊"化學）或膦活化試劑（Staudinger連接）進行檢測或偶聯(lián)。

當與膦活化熒光染料、生物素試劑或其他化合物結合使用時，這些疊氮基修飾的糖有助于研究涉及糖基化的細胞通路。

產品信息：

溫馨提示：Absin所有產品僅用于科學研究，請勿藥物、家用或其他用途。

[1] Miroslava Stastna, Jennifer E Van Eyk. Secreted proteins as a fundamental source for biomarker discovery[J]. Proteomics 2012, 12:722-735.

[2] Brown K J, Formolo1C A, Seol H, et al. Advances in the proteomic investigation of the cell secretome[J].

Expert Rev. Proteomic,2012,9(3):337-345.

[3] 毛源, 鄭江南, 封順, 等. 基于3種非天然糖代謝標記的分泌蛋白質組分析性能對比[J]. 色譜, 2021, 39(10):8.

[4] Laughlin S T, Bertozzi C R. Metabolic labeling of glycans with azido sugars and subsequent glycan-profiling and visualization via Staudinger ligation[J]. Nature Protocols, 2007,2(11):2930-2944.

[5] Boyce M, Carrico I S, Ganguli A S, et al. Metabolic cross-talk allows labeling of O-linked beta-N-acetylglucosamine-modified proteins via the N-acetylgalactosamine salvage pathway[J].PNAS, 2011,108(8):3141-3146.

[6] Nandi A, Sprung R, Barma D K, et al.Global identification of O-GlcNAc-modified proteins[J]. Anal. Chem. 2006, 78, 452-458.

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